Шреддер - зловісний лідер клану Фут! Головний противник Сплінтера і Черепашок.
З величезною армією і гострими обладунками для Шреддера немає нічого неможливого. Черепашки, будьте обережні!
Зброя: У Шредера на кожній руці закріплені кілька гострих клинків.
Кренг - позаземний розум, який прибув захопити людство!
Зловісні і владні Кренги - інопланетні мізки зі щупальцями, прибули на землю, щоб поневолити людство. Пересуваються, керуючи роботами-екзоскелетами, які можуть приймати людську подобу.
Зброя: Кренги володіють лазерними гарматами, небезпечними для черепашок.
Фут Ніндзя - соратники Шредера. Покірні, безшумні і нещадні солдати клану Фут живуть заради однієї мети: служити своєму лідерові - лиходієві Шредеру!
Озброєні до зубів, вони вселяють страх в кожного, хто побачить їх великі очі і червоні бандани, але тільки не Черепашок.
Зброя: У кожного воїна Фут своя зброя: мечі, списа, сокира, тризуб. Елітні ніндзя мають можливість телепортуватися, що допомагає їм уникнути атаки так ефектно з'явитися.